Scientific journal
International Journal of Applied and fundamental research
ISSN 1996-3955
ИФ РИНЦ = 0,556

SYNTHESIS AND IN SILICO STUDY OF THE PHARMACOLOGICAL ACTIVITY OF NEW N-(2-BENZYLOXY-2-OXOETHYL) DERIVATIVES OF NITROGEN-CONTAINING HETEROCYCLIC COMPOUNDS

Timofeeva Yu.A. 1 Pokrovskaya Yu.S. 1 Finageeva M.O. 1 Kuzminov O.V. 1
1 Federal State Budgetary Educational Institution of Higher Education «Volgograd State Medical University» of the Ministry of Health of the Russian Federation
The targeted search and creation of new compounds with predetermined pharmacological activity remain a paramount objective in the field of medicinal chemistry. This work concerns the synthesis and in silico predictive assessment of the pharmacological potential of new N-substituted ester derivatives of nitrogen-containing heterocycles. The synthesis of the target compounds was carried out using two methods: classical N-alkylation of heterocycles (benzimidazole, 2-hydroxybenzimidazole, benzotriazole, adenine) with benzyl bromoacetate in dimethylformamide medium, and by the “fusion” method of trimethylsilyl derivatives with benzyl bromoacetate (uracil, thymine, quinazoline-2,4(1H,3H)-dione). The structures of the compounds were confirmed by nuclear magnetic resonance spectroscopy: ¹H and ¹³C spectroscopy. Prediction of pharmacological activity was performed using the advanced intelligent web service PASS Online, which estimates the probabilities of biological effects based on the analysis of molecular structure. A series of new compounds were synthesized with satisfactory yields. Computational prediction for the key derivative, 1-(2-benzyloxy-2-oxoethyl)benzotriazole, revealed a high probability of inhibitory activity against thymidine kinase, as well as inhibition of other oxidoreductases (Nicotinamide Adenine Dinucleotide Phosphate peroxidase, phthalate 4,5-dioxygenase), which may indirectly indicate the anticancer potential of the compound series. The obtained spectrum of presumed activity allows considering these heterocyclic ester derivatives and their analogs as promising candidates for further in-depth experimental in vitro study as potential anticancer agents.
N-alkylation
nitrogen-containing heterocycle
pharmacological activity
PASS Online

Введение

Сложноэфирные производные азотсодержащих гетероциклических соединений представляют собой ценные синтоны для получения разнообразных фармакологически активных веществ. Высокая реакционная способность сложноэфирной группы по отношению к нуклеофильным агентам позволяет легко получать на их основе соединения амидного типа. В настоящее время на основе сложноэфирных производных пиримидиновых соединений осуществляется направленный синтез веществ, содержащих линейные и циклические гуанидиновые фрагменты в своей структуре. Соединения указанного типа проявили себя в качестве высокоэффективных ингибиторов натрий-водородного обменника первого типа (NHE-1) [1; 2]. Подобные соединения, содержащие фрагменты гуанидина в своей структуре, рассматриваются как потенциальные нейро- и кардиопротекторные лекарственные средства [3; 4].

Однако самостоятельная фармакологическая активность указанных промежуточных сложноэфирных производных азотсодержащих гетероциклических соединений исследована в недостаточной степени, и имеются лишь отдельные публикации на эту тему. В частности, описан 1-(2-бензилокси-2-оксоэтил)хиназолин-4(3Н)-он (1) (рис. 1), содержащий фрагмент бензилацетата в качестве заместителя в положении N3 и проявивший высокую активность в отношении золотистого стафилококка и ряда других возбудителей бактериальных инфекций in vitro [5; 6] при низкой острой токсичности in vivo [7].

Рис. 1. 1-(2-Бензилокси-2-оксоэтил)хиназолин-4(3Н)-он Примечание: составлено авторами на основе источников [5; 6]

В связи с этим представляет существенный интерес синтез и прогностическое исследование in silico фармакологической активности других гетероциклических производных с аналогичным характером замещения при атомах азота.

Цели исследования – проведение направленного синтеза новых N-замещенных сложноэфирных производных азотсодержащих гетероциклических соединений и последующая прогностическая оценка их фармакологического потенциала с использованием методов in silico для выявления возможной биологической активности, в том числе противоопухолевой.

Материалы и методы исследования

Синтез целевых соединений осуществляли двумя методами:

1. Классическое N-алкилирование гетероциклов (бензимидазол, 2-оксибензимидазол, бензотриазол, аденин) бензилбромацетатом в среде диметилформамида в присутствии калия карбоната при комнатной температуре.

2. Метод «сплавления» триметилсилилпроизводных урацила, тимина и хиназолин-2,4(1H,3H)-диона с бензилбромацетатом при нагревании без растворителя (140–180°C) с удалением летучих продуктов в вакууме.

Структура синтезированных соединений подтверждена методами ЯМР-спектроскопии (¹H и ¹³C) на спектрометре Bruker Avance 600 в ДМСО-d₆.

Температуры плавления определены в капиллярах на приборе Mel-Temp 3.0.

Контроль чистоты проводили методом тонкослойной хроматографии на пластинах Silica gel 60 F₂₅₄.

Прогноз выполнен с использованием веб-сервиса PASS Online, который оценивает вероятности биологических эффектов на основе анализа молекулярной структуры.

Результаты исследований и их обсуждение

Наиболее простым и удобным «классическим» методом N-алкилирования азотсодержащих гетероциклических соединений является их взаимодействие с соответствующим алкилирующим агентом в среде безводного диметилформамида при наличии калия карбоната, при температуре 20-25 °С [8]. Этот метод широко используется в тех случаях, когда N-алкилирование не сопровождается образованием изомерных продуктов. Авторами обнаружено, что N-алкилирование бензимидазола, 2-оксибензимидазола и бензотриазола бензилбромацетатом в указанных условиях приводит исключительно к N1-замещенным производным, а в случае аденина единственным направлением реакции является N9-замещение с удовлетворительным выходом целевых продуктов (36-48%) (рис. 2).

Рис. 2. Алкилирование бензимидазола, 2-оксибензимидазола, бензотриазола и аденина бензилбромацетатом Примечание: составлено авторами на основе полученных данных в ходе исследования

Рис. 3. Алкилирование триметилсилилпроизводных урацила, тимина и хиназолин-2,4(1Н,3Н)-диона бензилбромацетатом Примечание: составлено авторами на основе полученных данных в ходе исследования

Алкилирование урацила и его производных в идентичных условиях приводит к смеси N1-моно- и N1,N3-дизамещенных производных, разделение которых часто бывает малоэффективным. Особенно осложнено N-алкилирование производных урацила, содержащих заместители в положении 6 пиримидиновой системы, в том числе хиназолин-2,4(1Н,3Н)-диона, что приводит к стерическим затруднениям процессов алкилирования в положении N1 [9]. В связи с этим для повышения региоселективности N-алкилирования в среде диметилформамида при наличии калия карбоната используются иные субстраты, в частности N1,N3-дибензоилпроизводные пиримидиновых оснований [10; 11]. Также для селективного получения N1-монозамещенных производных урацила широко применяется модифицированный метод Гилберта – Джонсона, основанный на использовании триметилсилилпроизводных урацила и его аналогов в качестве субстратов [12]. Недостатком этого метода является то, что в нем могут быть использованы только алкилирующие агенты с высокой реакционной способностью, например альфа-галоидэфиры. Сложные эфиры бромуксусной кислоты обладают значительно более низкой реакционной способностью по сравнению с альфа-галоидэфирами, в связи с чем их применение в обычных условиях этого метода (неполярная или малополярная среда, комнатная температура) не приводит к ожидаемым результатам. Ранее авторами была разработана оригинальная модификация метода Гилберта – Джонсона, существенно расширившая ряд используемых алкилирующих агентов. Сущность этого метода «сплавления» заключается во взаимодействии триметилсилилпроизводных урацила с такими алкилирующими агентами, обладающими средней реакционной способностью, как 1-бром-2-феноксиэтаны или сложные эфиры альфа-галогенкарбоновых кислот, при нагревании без растворителя при температуре 140-180 °С с удалением образующегося триметилхлорсилана или триметилбромсилана в вакууме [13]. В настоящем исследовании авторы использовали триметилсилилпроизводные урацила, тимина и хиназолин-2,4(1Н,3Н)-диона, выход целевых продуктов составил 50-68% (рис. 3).

Экспериментальная часть

Спектры ЯМР полученных соединений регистрировали на спектрометре Bruker Avance 600 (600 МГц для 1H и 150 МГц для 13C) в ДМСО-d6, внутренний стандарт – тетраметилсилан. Тонкослойная хроматография выполнена на пластинах TLC Silica gel 60 F254 с последующим проявлением в УФ-свете. Определение температуры плавления проводили в стеклянных капиллярах с помощью прибора Mel-Temp 3.0 (Laboratory Devices Inc., США).

Синтез N-замещенных сложноэфирных производных азотсодержащих гетероциклических соединений «классическим» методом

Соответствующий азотсодержащий гетероцикл (0,016 моль) и 3,5 г (0,024 моль) тонко измельченного калия карбоната перемешивают 30 мин. в 40 мл безводного ДМФА при комнатной температуре, добавляют 3,0 г (0,018 моль) бензилбромацетата и перемешивают при той же температуре в течение 48 ч. Фильтруют, фильтрат упаривают в вакууме, остаток растирают с 50 мл воды и выдерживают при температуре 0-5 °С в течение суток. Образовавшийся осадок отфильтровывают, промывают водой, сушат на воздухе и кристаллизуют из подходящего растворителя.

1-(2-Бензилокси-2-оксоэтил)бензимидазол (2). Выход 42%, Т. пл. 122-124 °С. Спектр ЯМР 1Н, δ, м. д.: 5,23 с (2Н, NСН2); 5,37 с (2Н, OСН2); 7,23-7,30 м (1Н, J = 7 Гц, Н5); 7,32-7,41 м (6Н, Н6, фенил); 7,57 д (1Н, J = 7 Гц, Н7); 7,72 д (1Н, J = 7 Гц, Н4); 8,27 с (1Н, Н2). Спектр ЯМР, 13С, δ, м. д.: 45,87; 67,07; 110,93; 119,94; 122,19; 123,01; 128,50; 128,71; 129,93; 134,77; 136,00; 143,68; 145,19; 168,77.

1-(2-Бензилокси-2-оксоэтил)-2-оксибензимидазол (3). Выход 36%, Т. пл. 106-110 °С. Спектр ЯМР 1Н, δ, м. д.: 4,84 с (2H, NCH2); 5,19 с (2H, OCH2); 7,07-7,09 м (2H, H5, H6); 7,19-7,21 м (2H, H4, H7); 7,32-7,37 м (5H, фенил). Спектр ЯМР 13С, δ, м. д.: 40,01; 42,51; 66,94; 108,87; 121,90; 128,39; 128,91; 129,38; 136,03; 153,92; 168,45.

1-(2-Бензилокси-2-оксоэтил)бензотриазол (4). Выход 40%, Т. пл. 105-109 °С. Спектр ЯМР 1H, δ, м. д.: 5,22 с (2H, NCH2); 5,88 с (2H, OCH2); 7,32-7,37 м (5H, фенил); 7,42 д (1H, J = 8 Гц, H4); 7,56 т (1H, J = 7,5 Гц, H6); 7.86 т (1H, J = 7,5 Гц, H5); 8,07 д (1H, J = 8 Гц, H7). Спектр ЯМР 13С, δ, м. д.: 40,01; 49,06; 67,32; 111,20; 119,63; 124,57; 128,06; 128,50; 128,92; 133,99; 135,81; 145,56; 167,74.

9-(2-Бензилокси-2-оксоэтил)аденин (5). Выход 48%, Т. пл. 218-219 °С. Спектр ЯМР 1Н, δ, м. д. :5,17 с (2Н, NСН2); 5,21 с (2Н, OСН2); 7,30-7,40 м (7Н, NH2, фенил); 8,16 с (1Н, Н8), 8,17 с (1Н, Н2). Спектр ЯМР, 13С, δ, м. д.: 43,96; 66,63; 118,27; 127,98; 128,21; 128,42; 135,39; 141,25; 149,73; 153,66; 155,97; 167,89.

Синтез N-замещенных сложноэфирных производных азотсодержащих гетероциклических соединений методом «сплавления»

Соответствующий азотсодержащий гетероцикл (0,016 моль) и 0,05 г аммония хлорида кипятят в 50 мл гексаметилдисилазана до образования прозрачного раствора. В ряде случаев, например при силилировании хиназолин-2,4(1Н,3Н)-диона, реакция силилирования протекает медленно и требует кипячения исходных реагентов в течение многих суток. Добавление 10 мл O,N-бис(триметилсилил)ацетамида, как более эффективного силилирующего агента, позволяет сократить длительность этого процесса до нескольких часов. Избыток гексаметилдисилазана удаляют в вакууме, к остатку добавляют 3,0 г (0,018 моль) бензилбромацетата и нагревают при температуре 160-165 °С в течение 2 ч при остаточном давлении 40-50 мм рт. ст. Охлаждают, добавляют 25 мл 95% этанола и 2 мл концентрированного аммония гидроксида и выдерживают при комнатной температуре в течение суток. Образовавшийся осадок отфильтровывают, промывают водой, сушат на воздухе и кристаллизуют из подходящего растворителя.

1-(2-Бензилокси-2-оксоэтил)урацил (6). Выход 56%, Т. пл. 196-200 °С. Спектр ЯМР-спектр, 1H, δ, м. д.: 4,59 с (2H, NCH2). 5,19 с (2H, OCH2); 5,61 д (1H, J = 8, H5); 7,32-7,39 м (5H, фенил); 7.63 д (1H, J = 8, H6);11,40 с (1H, NH). Спектр ЯМР 13C, δ, м. д.: 39,98; 49,13; 66,94; 101,61; 128,40; 128,93; 135,97; 146,28; 151,46; 164,19; 168,56.

1-(2-Бензилокси-2-оксоэтил)тимин (7). Выход 50%, Т. пл. 198-200 °С. Спектр ЯМР 1H, δ, м. д.: 1,75 с (3H, CH3); 4,55 с (2H, NCH2); 5,18 с (2H, OCH2); 7,33-7,37 м (5H, фенил); 7,51 с (1H, H6); 11,39 с (1H, NH). Спектр ЯМР 13C, δ, м. д.: 12,33; 39,99; 48,94; 66,89; 109,12; 128,39; 128,92; 136,00; 141,98; 151,44; 164,75; 168,65.

Расчетный спектр фармакологической активности 1-(2-бензилокси-2-оксоэтил)бензотриазола

Pa

Pi

Активность

0,764

0,010

Ингибитор АДФ-тимидинкиназы

0,729

0,022

Ингибитор НАДФ-пероксидазы

0,724

0,029

Ингибитор проницаемости мембран

0,709

0,033

Ингибитор D-глюкозилфосфадитолинозинфосфолипазы

0,681

0,018

Ингибитор фталат-4,5-диоксигеназы

0,655

0,012

Ингибитор митохондриальной пептидазы

0,665

0,024

Ингибитор эндо-1,6-бета-глюкозидазы

0,651

0,029

Ингибитор сфинганинкиназы

0,618

0,018

Ингибитор креатининазы

Примечание: Pa – вероятность (0-1) наличия активности; Pi – вероятность (0-1) отсутствия активности.

Составлено авторами на основе полученных данных в ходе исследования.

1-(2-Бензилокси-2-оксоэтил)хиназолин-2,4(1Н,3Н)-дион (8). Выход 68%, Т. пл. 233-236 °С. Спектр ЯМР 1Н, δ, м. д.: 5,00 с (2H, NCH2); 5,20 с (2H, OCH2); 7,29 т (1H, J = 8 Гц, H6); 7,34-7,37 м (6H, фенил, H8); 7,71 т (1H, J = 8 Гц, H7); 8,03 д (1H, J = 8 Гц, H5); 11,76 с (1H, NH). Спектр ЯМР 13С, δ, м. д.: 43,75; 66,51; 114,51; 115,43; 122,91; 127,60; 127,85; 128,13; 128,39; 135,31; 135,53; 140,83; 150,29; 161,63; 168,14.

Вычислительный прогноз фармакологической активности новых соединений был выполнен в ИИ-среде PASS Online [14]. Наиболее выраженной и таргетированной активностью среди всех синтезированных соединений, согласно прогнозу in silico, обладает 1-(2-бензилокси-2-оксоэтил)бензотриазол (4) (таблица). В таблице представлены прогнозируемые виды активности соединения 4, для которых разница между наличием и отсутствием вероятности активности составляет не менее 0,6.

Результаты прогноза свидетельствуют о том, что ведущим в спектре фармакологической активности новых соединений является ингибирование различных оксиредуктаз, что косвенно свидетельствует о вероятном наличии у них противоопухолевой активности [15]. Об этом же свидетельствует и потенциальная способность полученных веществ подавлять важнейшие пути клеточного метаболизма. Образцы всех синтезированных соединений переданы в Лабораторию клеточных технологий Научного центра инновационных лекарственных средств ВолгГМУ для тестирования in vitro.

Заключение

Синтезирован ряд соединений – сложноэфирных производных азотсодержащих гетероциклов, представляющих интерес в качестве потенциальных противоопухолевых лекарственных средств.